Une technologie Wraith transfère la conscience du Lieutenant Cadman dans la tête de McKay. Zelenka et McKay cherchent alors une manière de rétablir les choses
L'équipe d’Atlantis arrive sur une planète qui vit en relative harmonie avec un Wraith. Les habitants livrent leurs prisonniers et criminels aux Wraiths pour être en paix.
Ronox Dex découvre que son peuple n'a pas totalement été annihilé par les Wraith puis il part à la recherche de Kell, son ancien maître d’arme, pour régler quelques affaires.
Quand l'équipe découvre un vaisseau Ancient, McKay et Sheppard sont surpris de découvrir que l'équipage à bord connait une faiblesse à propos de la téchnologie Wraith.